Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIP12755 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIP12755 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIP12755 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIP12755 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIP12755 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIP12755 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIP12755 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIP12755 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIP12755 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIP12755 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIP12755 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIP12755 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIP12755 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIP12755 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIP12755 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIP12755 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms