Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F5P12259 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F5P12259 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F5P12259 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F5P12259 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F5P12259 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
F5P12259 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
F5P12259 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
F5P12259 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
F5P12259 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
F5P12259 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
F5P12259 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
F5P12259 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
F5P12259 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
F5P12259 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
F5P12259 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
F5P12259 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F5P12259 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
F5P12259 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
F5P12259 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
F5P12259 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
F5P12259 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
F5P12259 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
F5P12259 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
F5P12259 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
F5P12259 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
F5P12259 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F5P12259 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F5P12259 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
F5P12259 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F5P12259 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F5P12259 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
F5P12259 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
F5P12259 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F5P12259 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
F5P12259 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F5P12259 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F5P12259 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F5P12259 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
F5P12259 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
F5P12259 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
F5P12259 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
F5P12259 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
F5P12259 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
F5P12259 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
F5P12259 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
F5P12259 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
F5P12259 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
F5P12259 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
F5P12259 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
F5P12259 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
F5P12259 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms