Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSAP10619 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSAP10619 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSAP10619 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSAP10619 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSAP10619 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSAP10619 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSAP10619 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSAP10619 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSAP10619 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTSAP10619 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSAP10619 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSAP10619 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSAP10619 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSAP10619 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSAP10619 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSAP10619 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSAP10619 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms