Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM225BP0DP42 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms