Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
U2AF1L5P0DN76 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms