Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETSIPP0DME0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms