Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMIM6P0DI80 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM6P0DI80 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms