Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA6AP0CW24 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA6AP0CW24 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms