Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49CP0CI26 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49CP0CI26 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms