Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC172P0C7W6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms