Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UQCRFS1P1P0C7P4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UQCRFS1P1P0C7P4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UQCRFS1P1P0C7P4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UQCRFS1P1P0C7P4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UQCRFS1P1P0C7P4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UQCRFS1P1P0C7P4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UQCRFS1P1P0C7P4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms