Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP1P09874 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP1P09874 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP1P09874 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP1P09874 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP1P09874 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP1P09874 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP1P09874 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP1P09874 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP1P09874 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP1P09874 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP1P09874 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP1P09874 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP1P09874 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP1P09874 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP1P09874 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP1P09874 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP1P09874 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP1P09874 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP1P09874 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP1P09874 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP1P09874 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP1P09874 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP1P09874 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP1P09874 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP1P09874 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP1P09874 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP1P09874 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP1P09874 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP1P09874 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP1P09874 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP1P09874 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP1P09874 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP1P09874 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP1P09874 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP1P09874 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP1P09874 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP1P09874 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP1P09874 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms