Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT7P08729 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT7P08729 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT7P08729 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT7P08729 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT7P08729 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT7P08729 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT7P08729 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT7P08729 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT7P08729 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT7P08729 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT7P08729 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT7P08729 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT7P08729 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT7P08729 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT7P08729 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT7P08729 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT7P08729 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT7P08729 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT7P08729 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT7P08729 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms