Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN3P07498 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN3P07498 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN3P07498 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN3P07498 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms