Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTAP01374 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTAP01374 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTAP01374 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LTAP01374 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTAP01374 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LTAP01374 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LTAP01374 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LTAP01374 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTAP01374 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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LTAP01374 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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LTAP01374 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTAP01374 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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