Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RP00736 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RP00736 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1RP00736 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1RP00736 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1RP00736 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1RP00736 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1RP00736 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1RP00736 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1RP00736 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1RP00736 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RP00736 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RP00736 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RP00736 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RP00736 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RP00736 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RP00736 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RP00736 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RP00736 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RP00736 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RP00736 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RP00736 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms