Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F13A1P00488 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F13A1P00488 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F13A1P00488 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F13A1P00488 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F13A1P00488 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F13A1P00488 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F13A1P00488 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F13A1P00488 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F13A1P00488 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F13A1P00488 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F13A1P00488 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F13A1P00488 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F13A1P00488 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F13A1P00488 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F13A1P00488 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F13A1P00488 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F13A1P00488 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F13A1P00488 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F13A1P00488 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F13A1P00488 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
F13A1P00488 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F13A1P00488 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F13A1P00488 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F13A1P00488 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
F13A1P00488 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms