Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms