Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

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Length 4,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC2O95714 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC2O95714 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC2O95714 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC2O95714 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC2O95714 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC2O95714 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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