Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF12O95522 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms