Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24BO95487 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms