Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
UBE4BO95155 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms