Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNKO75909 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNKO75909 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNKO75909 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNKO75909 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNKO75909 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNKO75909 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNKO75909 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNKO75909 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNKO75909 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNKO75909 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNKO75909 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms