Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN15O75808 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN15O75808 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms