Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OFD1O75665 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OFD1O75665 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OFD1O75665 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OFD1O75665 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OFD1O75665 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OFD1O75665 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OFD1O75665 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OFD1O75665 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OFD1O75665 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OFD1O75665 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OFD1O75665 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OFD1O75665 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OFD1O75665 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OFD1O75665 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OFD1O75665 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms