Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms