Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZIC3O60481 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC3O60481 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms