Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALUO43852 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALUO43852 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALUO43852 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALUO43852 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALUO43852 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALUO43852 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALUO43852 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALUO43852 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALUO43852 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALUO43852 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALUO43852 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALUO43852 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALUO43852 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALUO43852 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms