Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms