Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLX3O43711 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLX3O43711 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TLX3O43711 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TLX3O43711 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TLX3O43711 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TLX3O43711 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLX3O43711 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLX3O43711 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLX3O43711 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLX3O43711 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLX3O43711 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TLX3O43711 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms