Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD6O43541 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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