Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms