Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI1O43347 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSI1O43347 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSI1O43347 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSI1O43347 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI1O43347 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI1O43347 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI1O43347 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI1O43347 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI1O43347 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI1O43347 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms