Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC1O15269 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms