Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms