Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBAG9O00559 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms