Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAPO00193 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAPO00193 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAPO00193 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAPO00193 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAPO00193 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAPO00193 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAPO00193 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAPO00193 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAPO00193 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAPO00193 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAPO00193 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAPO00193 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAPO00193 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAPO00193 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAPO00193 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAPO00193 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAPO00193 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAPO00193 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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