Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms