Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3BRM9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3BRM9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3BRM9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3BRM9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H3BRM9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BRM9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BRM9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BRM9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3BRM9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3BRM9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3BRM9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3BRM9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H3BRM9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3BRM9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3BRM9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms