Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4E1Z4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4E1Z4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4E1Z4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
B4E1Z4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
B4E1Z4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4E1Z4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4E1Z4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4E1Z4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4E1Z4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4E1Z4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4E1Z4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4E1Z4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4E1Z4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4E1Z4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4E1Z4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4E1Z4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4E1Z4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4E1Z4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4E1Z4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4E1Z4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4E1Z4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms