Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms