Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms