Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PP2D1A8MPX8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PP2D1A8MPX8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PP2D1A8MPX8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms