Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms