Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNZ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNZ2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNZ2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNZ2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNZ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNZ2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNZ2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNZ2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNZ2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNZ2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNZ2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNZ2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNZ2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNZ2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNZ2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNZ2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNZ2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNZ2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNZ2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNZ2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNZ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNZ2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNZ2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNZ2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNZ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNZ2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNZ2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNZ2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNZ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNZ2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNZ2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNZ2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNZ2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A6NNZ2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A6NNZ2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms