Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms