Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF316A6NFI3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms