Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms