Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms