Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM247A6NEH6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms